Openbabel 工具

全能分子文件格式转换工具,支持多种化学文件格式互转

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工具说明

Openbabel 是什么?

Openbabel 是一个开源的化学工具箱,主要用于化学文件格式转换。它支持超过110种化学文件格式,包括SDF、MOL、PDB、SMILES等,是化学信息学研究中不可或缺的工具。

主要功能

  • 多种化学文件格式互转
  • 分子结构优化与能量最小化
  • 分子描述符计算
  • 支持命令行和图形界面
使用指南

三步完成转换

  1. 上传需要转换的化学文件
  2. 指定目标格式(如:pdb, mol2, sdf)
  3. 点击提交按钮等待转换完成

支持格式示例

PDB MOL2 SDF SMILES XYZ
格式转换工具
上传文件并设置参数
支持格式:PDB, MOL2, SDF, SMILES, XYZ 等(最大100MB)
请输入目标格式的标准缩写(小写字母)
注意事项
  • 确保上传的文件格式正确
  • 目标格式请使用标准缩写(如:pdb, mol2)
  • 大文件转换可能需要较长时间
  • 转换结果会自动下载到本地

常见问题

Q: 支持哪些格式?

A: 支持110+种格式,常用格式包括PDB、MOL2、SDF等。

Q: 文件大小限制?

A: 最大支持100MB的文件。

Q: 转换需要多长时间?

A: 通常几秒到几分钟,取决于文件大小和复杂度。

本站提供结构转化和模型建立输出文件不保证完全符合模拟需求,如有其他要求或者复杂模型请联系我们进行合作交流
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