TIP3P 转 TIP4P

将 TIP3P 水分子模型转换为 TIP4P 水分子模型

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工具说明

什么是 TIP3P 转 TIP4P?

TIP3P(三点水模型)和 TIP4P(四点水模型)是常用的水分子模型。TIP4P 模型在氧原子上增加了一个虚设位点,能更准确地描述水的四极矩和密度等性质。

适用场景

  • 需要更精确的水性质描述时升级水模型
  • 在不同力场参数之间转换
  • 准备 TIP4P 水模型的模拟初始结构
使用指南

使用方法

  1. 准备 TIP3P 水模型的 GRO 文件
  2. 上传 GRO 文件
  3. 提交转换,下载结果

注意事项

仅支持 GRO 格式 仅转换水分子 保留体系其他原子
文件转换
上传文件
包含 TIP3P 水分子的 GRO 格式结构文件
注意事项
  • 仅支持 GRO 格式输入文件
  • 仅转换体系中的 TIP3P 水分子
  • 非水分子原子保持不变
  • 转换后可直接用于 GROMACS 模拟
本站提供结构转化和模型建立输出文件不保证完全符合模拟需求,如有其他要求或者复杂模型请联系我们进行合作交流
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