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一键成膜

快速生成细胞膜双分子层

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溶剂化

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拓扑生成

从分子结构生成拓扑文件

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胶束生成器

球面均匀分布生成胶束模型

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Acpype 拓扑

从 mol2 生成 GROMACS 拓扑文件

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在线功能

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分子结构平移

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配位数分析

Coordination Number — 计算配位数分布

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MDP 参数生成

MDP Generator — 生成模拟参数文件

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NDX 索引生成

NDX Generator — 创建分子索引文件

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XVG 数据分析

XVG Analysis — 分析 XVG 格式数据文件

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模型下载

精选分子动力学模型文件，加速您的模拟研究

周期纤维素模型

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聚乙烯吡咯烷酮PVP模型

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菱锌矿模型

0.7 MB

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钙钛矿模型

0.4 MB

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聚海藻酸钠模型

0.0 MB

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硫代硫酸根模型

0.0 MB

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模拟工作流

从结构到分析，一站式完成

01

结构准备

PDB 修正、格式转换、模型下载

02

系统构建

溶剂化、拓扑生成、力场参数

03

参数计算

粗粒化参数、Morse 势能制表

04

分析提交

结构分析、结果下载、专家支持

学习资源

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教学视频

分子动力学模拟教程与技术分享

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