快速生成POPC细胞膜双分子层,支持嵌入蛋白质或生成纯膜。
使用Fibonacci球体算法将分子分布在球面上,快速生成球形胶束模型。
使用 cellulose-builder 脚本自动生成不同尺寸的纤维素纤维模型(原纤丝结构),输出标准 PDB 文件。
使用genice2快速生成不同晶型的冰晶分子模型,支持tip3p/tip4p/tip5p水模型。
快速为蛋白质、多糖、核酸和聚合物模型添加溶剂盒子、离子,生成完整的GROMACS模拟系统。
使用 ACPYPE 工具从 mol2 文件生成 GROMACS 兼容的拓扑文件,支持多种 Amber 力场(gaff/amber/gaff2)。
从分子结构快速生成拓扑文件,简化分子模拟流程。
生成GROMACS/CHARMM兼容的拓扑文件,简化模拟准备工作。
GROMACS相关工具和功能。
分子势能参数计算工具。
计算粗粒化分子动力学模拟所需参数,优化计算效率。
分子动力学模拟工具集。
支持多种分子文件格式转换,实现不同软件间的无缝对接。
专业的PDB文件预处理工具,支持分子结构调整和格式优化。
将TIP3P水分子模型转换为TIP4P水分子模型,输入GRO格式文件。
无论您是学术研究者还是工业界专业人士,我们都能为您提供专业的计算模拟支持。
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